La Unidad Educativa San Joaquín, por disposición del Ministerio de Educación mediante Resolución Nª 001-CEZ-6 emitido por la coordinación de Educación zonal 6, resuelve unificar la Escuela Rafael María Arízaga jornada matutina con Colegio San Joaquín, jornada vespertina,   el 8 de agosto del 2012, suscrito por la Lic. María Eugenia Verdugo, coordinadora de Educación Zonal 6   y Mario Guartazaca Zhicay, se nomina como rectora a la Lic. Mariana Murillo, con  número de estudiantes es de 1173 estudiantes, divididos en dos jornadas, ofertándose el bachillerato en Ciencias (BGU) desde el año 2011; con 43 docentes, como personal administrativo.

Se toma como fecha de creación, por tema de administración en el documento AMIE, 01 de diciembre de 1981, del colegio San Joaquín.

El Jefe de Planeamiento Coordinación de Educación Zonal 6El 24 de marzo del 2016 con resolución: Nro. MINIDEDUC-CZ6-2016-00276-R, se autoriza la creación del Inicial II, grupo 3 y 4 años.

El 27 de julio de 2020, con Oficio Nro. MINEDUC-CZ6-01D01-2020-2092-O, se autoriza y amplia en el sistema GIA, la creación del Bachillerato técnico en la FIP de Informática en la jornada matutina y FIP de Contabilidad en la jornada matutina.

En este año lectivo se oferta los niveles desde Inicial II, grupo 3 y 4 años, Educación General Básica y Bachillerato en Ciencias, FIP Informática y FIP Contabilidad. Con un total de 810 estudiantes que provienen de la comunidad y de otras provincias, con 39 docentes, 5 autoridades, 1 administrativo.

Contamos con 51 docentes y dos administrativos, el Lic. Eduardo Zambrano Asanza, Rector Encargado, Mgs. Sonia Villa Chacho, Vicerrectora Encargada jornada matutina, Lic. Paúl Barrera Medina, Vicerrector Vespertino. EL Plantel cuenta con dos laboratorios de computación, un laboratorio de Ciencias Naturales, una Sala de Audiovisuales, que son utilizados por los estudiantes para que desarrollen destrezas y habilidades para llegar a ser personas emprendedoras.